signature グラフ new

signature グラフでは検出したmutation についてsignatureとその集積を積み上げグラフで表示します。

signature:signatureを表示します。
積み上げグラフ:サンプルごとmutationについて、signatureの割合を表示します。
_images/sig_dummy.PNG

また、積み上げグラフの下のリストボックスにより表示モードを切り替えることができます。

view mode:
  • rate ... mutationの数を1としたときのsignatureの割合を % で表示します。
  • integral ... 実際のmutation数に対する割合を表示します。
sort by:
  • sampleID ... サンプルID順
  • mutation count ... mutation数の降順

view modeがintegralの場合のみ、ソート方法を選択できます。

view mode 「integral」, sort by 「mutation count」の表示例

_images/sig_operation1.PNG

pmsignatureについても同様です。

_images/pmsig_dummy.PNG