CA グラフ

CA (Chromosomal Aberration) グラフではStructural Variation (SV) 等、Chromosome間の変異を円形のplotで可視化し、棒グラフでその分布を表示します。

• 棒グラフでは全サンプルでbreakpointを集計した数を表示します。
• 円形のplotでは、サンプルごとにbreakpoint1と2を線でつないで表示します。

棒グラフを選択すると選択されたgenome領域にbreakpointを持つサンプルが選択されます。

選択方法は「ハイライト」と「選択したもののみ表示（他を隠す）」の2とおりあり、先頭のオプションボタンで選択できます。

棒グラフのstackは2つあり、2つのbreak pointがchromosome を超えているか、もしくは同一 chromosome 内かで色を分けています。

チェックを外すと、その要素は表示されません。

サンプルごとの円形のグラフをクリックすると拡大表示します。

breakpointをつなぐ線の上にマウスを乗せると詳細を表示します。